Tooted

Substraadi ja valgu interaktsioonide kaardistamiseks on kasutatud infrapunaspektroskoopiat: sarkoplasmaatilise retikulumi Ca(2+)-ATPaasi konformatsioonilisi muutusi nukleotiidide seondumisel ja ATPaasi fosforüülimisel jälgiti substraadi ATP ja ATP analoogide (2'-deoksü-ATP, 3) abil. '-deoksü-ATP ja inosiin-5'-trifosfaat), mida modifitseeriti substraadi spetsiifilistes funktsionaalrühmades.Adeniini 2'-OH, 3'-OH ja aminorühma modifikatsioonid vähendavad ATPaasi seondumisest põhjustatud konformatsioonilise muutuse ulatust, kusjuures kahe viimase puhul on täheldatud eriti tugevat mõju.See näitab nukleotiidi-ATPaasi kompleksi struktuurset tundlikkust nukleotiidi ja ATPaasi vaheliste individuaalsete interaktsioonide suhtes.Kõik uuritud rühmad on seondumiseks olulised ja antud ligandirühma interaktsioonid ATPaasiga sõltuvad teiste ligandirühmade interaktsioonidest.ATPaasi fosforüülimist täheldati ITP ja 2'-deoksü-ATP puhul, kuid mitte 3'-deoksü-ATP puhul.Nukleotiidide seondumisel tekkivate konformatsiooniliste muutuste ulatuse ja fosforüülimise kiiruse vahel puudub otsene seos, mis näitab, et ATP-indutseeritud konformatsioonimuutuse kogu ulatus ei ole fosforüülimise jaoks kohustuslik.Nagu nukleotiid-ATPaasi kompleksi puhul täheldati, sõltub ka esimese fosforüülitud ATPaasi vaheühendi E1PCa (2) konformatsioon nukleotiidist, mis näitab, et ATPaasi olekutel on vähem ühtlane konformatsioon, kui varem eeldati.